閉じるボタンで閉じても1回で閉じられず、空のExcel(Excelを1つも開いていない状態の画面)が残る場合があります。 これはExcel2013では解消されているので、Excel2007から2010までの不具合と思われます。 空のExcelが表示された時、[表示]-[ウィンドウ]-[再表示]を選べれば原因はそこです。 マクロで「個人用マクロブック」を使用するようにしていた場合など、非表示になっているブックが存在したらそのような現象になようです。